Το Τμήμα Διοίκησης Επιχειρήσεων του Πανεπιστημίου Αιγαίου οργανώνει και λειτουργεί από το ακαδημαϊκό έτος 2001 - 2002 Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στη Διοίκηση Επιχειρήσεων (ΦΕΚ 1777, τ. Β΄/31.12.01, όπως τροποποιήθηκε από το ΦΕΚ 1537, τ. Β΄/17.10.03 & το ΦΕΚ 692, τ. Β΄/23.05.05), το οποίο απονέμει:
Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης στη Διοίκηση Επιχειρήσεων (Μ.Β.Α.) με τρεις κατευθύνσεις:
- Διοίκηση Επιχειρησιακών Λειτουργιών - Παραγωγή
- Λογιστική - Ελεγκτική
- Διοίκηση Ανθρώπινων Πόρων
Η ελάχιστη χρονική διάρκεια για την απονομή τού Μ.Δ.Ε. είναι τρία διδακτικά εξάμηνα.
Κατά το ακαδημαϊκό έτος 2011 - 2012 θα εισαχθούν στο Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στη Διοίκηση Επιχειρήσεων (Μ.Β.Α.) έως 40 μεταπτυχιακοί φοιτητές. Οι υποψήφιοι καλούνται να δηλώσουν στην αίτησή τους την κατεύθυνση που τους ενδιαφέρει, ενώ σε περίπτωση που ενδιαφέρονται για περισσότερες κατευθύνσεις τις δηλώνουν κατά σειρά προτίμησης.

Στο Π.Μ.Σ. στη Διοίκηση Επιχειρήσεων γίνονται δεκτοί πτυχιούχοι τμημάτων:
α) Διοίκησης Επιχειρήσεων και Οικονομικών Σπουδών
β) Πολυτεχνικών Σχολών
γ) Θετικών Επιστημών
δ) Επιστημών Πληροφορικής
ε) Νομικής
στ) Φιλοσοφικών σχολών
της ημεδαπής ή αναγνωρισμένων ομοταγών ιδρυμάτων της αλλοδαπής. Στο Π.Μ.Σ. στη Διοίκηση Επιχειρήσεων γίνονται επίσης δεκτοί πτυχιούχοι ΑΤΕΙ, με την προϋπόθεση ότι, πριν από την αξιολόγηση της αίτησής τους, θα έχουν εξετασθεί επιτυχώς σε τέσσερα μαθήματα (Μαθηματικά, Διοίκηση - Οργάνωση Επιχειρήσεων Α΄, Λογιστική Β΄, Χρήση και Προγραμματισμός Υπολογιστών) του προπτυχιακού προγράμματος σπουδών του Τμήματος Διοίκησης Επιχειρήσεων, το Μάιο - Ιούνιο 2011, στη Χίο.

Για την απόκτηση του Μεταπτυχιακού Διπλώματος είναι υποχρεωτική η παρακολούθηση και η επιτυχής εξέταση σε 12 υποχρεωτικά μαθήματα στο πρώτο και δεύτερο εξάμηνο, ενώ στο τρίτο πραγματοποιείται η εκπόνηση της διπλωματικής εργασίας.
Η επιλογή των υποψηφίων γίνεται κατόπιν αξιολόγησής τους κατά τη διάρκεια προφορικής συνέντευξης, η οποία θα πραγματοποιηθεί στη Χίο το Μάιο - Ιούνιο 2011, σε ημερομηνία που θα γνωστοποιηθεί εγκαίρως από τη γραμματεία και την ιστοσελίδα του Πανεπιστημίου Αιγαίου.
Για την παρακολούθηση του Π.Μ.Σ. προβλέπεται η καταβολή διδάκτρων, ύψους 1.500 ευρώ για κάθε εξάμηνο, τα οποία θα καταβάλλονται εφάπαξ πριν από την έναρξη του αντίστοιχου εξαμήνου. Σημειώνεται ότι παρέχεται σημαντικός αριθμός υποτροφιών στους μεταπτυχιακούς φοιτητές με την υψηλότερη επίδοση στα μαθήματα.
Οι αιτήσεις των υποψηφίων θα γίνονται δεκτές από τη γραμματεία τού Π.Μ.Σ. στη Διοίκηση Επιχειρήσεων του Πανεπιστημίου Αιγαίου, Μιχάλων 8, Τ.Κ. 82100 - Χίος (τηλ. επικοινωνίας 22710 35122 & 35120, από 10:00 έως 14:00, fax: 22710 35129, e-mail: Αυτή η διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου προστατεύεται από τους αυτοματισμούς αποστολέων ανεπιθύμητων μηνυμάτων. Χρειάζεται να ενεργοποιήσετε τη JavaScript για να μπορέσετε να τη δείτε.), το αργότερο μέχρι 30 Απριλίου 2011 (σφραγίδα ταχυδρομείου).