Ως το πρώτο βήμα για να υπάρξει διαφάνεια και αντικειμενικότητα στην επιχορήγηση συλλόγων και φορέων του Αιγαίου χαρακτήρισε η υφυπουργός Θαλασσίων Υποθέσεων την έναρξη λειτουργίας του Μητρώου Φορέων Αιγαίου, καθώς και τη σύσταση επιτροπής αξιολόγησης για τις επιχορηγήσεις.

Στο Μητρώο μπορούν να εγγραφούν όλοι οι μη κερδοσκοπικοί φορείς που αναπτύσσουν δραστηριότητα στο χώρο ευθύνης της Γενικής Γραμματείας Αιγαίου και Νησιωτικής Πολιτικής.
Η υποβολή των απαραίτητων στοιχειών θα γίνεται ηλεκτρονικά μέσω ειδικής εφαρμογής, η οποία έχει σχεδιασθεί ειδικά για το σκοπό αυτό από τη Γενική Γραμματεία Αιγαίου και Νησιωτικής Πολιτικής. Η πρόσβαση στην εφαρμογή γίνεται μέσω του ιστοτόπου της Γενικής Γραμματείας Αιγαίου και Νησιωτικής Πολιτικής στην ηλεκτρονική διεύθυνση http://www.ypai.gr και με παραπομπή στο εικονίδιο «Μητρώο Φορέων».
Η επιτροπή αξιολόγησης θα είναι πενταμελής και θα αποτελείται από ένα θεατρολόγο ή θεατρικό συγγραφέα, ένα μουσικολόγο, ένα λογοτέχνη, έναν εικαστικό της Σχολής Καλών Τεχνών και έναν εκπρόσωπο του αθλητισμού, που κατάγονται από τα νησιά του Αιγαίου ή έχουν επιφανή δράση σε αυτά.
Στην επιτροπή θα συμμετέχει ο εκάστοτε διευθυντής της Διεύθυνσης Πολιτισμού της Γενικής Γραμματείας Αιγαίου και Νησιωτικής Πολιτικής, χωρίς δικαίωμα ψήφου αλλά ως εισηγητής, καθώς και ένας υπάλληλος της ίδια Διεύθυνσης, για τη γραμματειακή υποστήριξη.
Προσωρινώς και μέχρι τις 31 Δεκεμβρίου 2011 ορίστηκε τριμελής επιτροπή από διευθυντικά στελέχη της Γραμματείας, η οποία θα συνεδριάζει μετά από πρόσκληση του γενικού γραμματέα Αιγαίου και Νησιωτικής Πολιτικής.

Η επιτροπή, κατά την αξιολόγηση των αιτημάτων, θα στηρίζεται σε καθορισμένα κριτήρια, με ενδεικτικά τα:
- Αξιοπιστία του φορέα (προφίλ συντελεστών, εμβέλεια δραστηριότητας, παρελθούσα συνεργασία, ιδιαίτερα χαρακτηριστικά)
- Γεωγραφικά κριτήρια
- Δράση (διάσταση της πρότασης, αν είναι η πρώτη φορά ή αν έχει ξαναγίνει, αν είχε επιτυχία και αν οι συντελεστές διασφαλίζουν αποτέλεσμα ποιότητας της δραστηριότητας)
- Ένταξη δράσης στην πολιτική επιχορηγήσεων του Υπουργείου (ενίσχυση του πολιτισμικού στοιχείου σε απομακρυσμένες περιοχές, προβολή του σύγχρονου πολιτισμικού στοιχείου)
- Οικονομική-διαχειριστική διάσταση της πρότασης (πληρότητα, φερεγγυότητα, επάρκεια προγραμματισμού, εξασφάλιση χρηματοδότησης από άλλες πηγές, πληρότητα απολογισμού από προηγούμενη επιχορήγηση, υπευθυνότητα φορέα σε προηγούμενη συνεργασία με το Υπουργείο)
Σε δήλωσή της, η υφυπουργός Θαλασσίων Υποθέσεων, Νήσων και Αλιείας, Ελπίδα Τσουρή, ανέφερε μεταξύ άλλων πως το Μητρώο είναι ένας μηχανισμός καταγραφής, παρακολούθησης και αξιολόγησης του έργου και της εξέλιξης των επιχορηγούμενων φορέων, για να μπορεί να κρίνεται η δραστηριότητά τους με ορθολογικά και συνεπή κριτήρια.